طراحی در نیلپر به عنوان مغز متفکر حوزه تولید، وظیفه انتخاب، طراحی محصول جدید، بهینهسازی محصولات موجود، استانداردسازی مواد و فرایندها و ایجاد بانک اطلاعات فنی جامع را در قالب روش اجرایی طراحی بر عهده دارد.
از وجوه تمایز شرکت نیلپر با سایر تولیدکنندگان، میتوان به درونیسازی فرایندهایی نظیر جوشکاری، برشکاری و پرسکاری اشاره کرد. هدف از انجام عملیات درونیسازی، اعمال نظارت کامل و اطمینان از کیفیت مناسب مواد اولیه مصرفی و همچنین فرایندهای ساخت است.